За двести лет до событий игры некий унитолог Олтман (Altman) обнаружил на Земле Черную Метку. Нужно пояснить, что в мире игры Dead Space церковь Унитологии стоит выше законноизбранного правительства Земли. Правительство похитило Маркер у Церкви. Оно вложило в его исследование огромные ресурсы и создала его точную копию. Однако, из-за отсутствия возможности использовать те же материалы, что были использованы при создании Черной Метки, копия приобрела красный оттенок и была названа Красной Меткой.
Олтман был одним из главных ученых, учавствоваших в проекте. Он хотел рассказать о сделанной копии церкви и всему остальному миру, однако было решено, что он слишком много знал и должен был быть устранен. Это привело к еще большему разладу между правительством и церковью. Из-за проблем с финансированием и из-за возможных конфликтов было решено переместить Красный Маркер на планету Эгида-7  в системе Эгида.
Там же был полностью расшифрован репликационный код, обнаруженный в Черном Обелиске. С его помощью были созданы бактерии, которое могли инфецировать и изменять мертвые клетки. Также стало известно, что Маркер может влиять на эти бактерии, вводя их в некую форму спячки.
После тестового запуска Красной Метки на планете Эгида-7 произошел кризис, сходный с тем, что произошел в колонии и на Ишимуре 200 лет спустя. Из-за воздействия Обелиска некоторые ученые покончили с собой. Их тела, судя по отчетам, были инфецированы вируосм и были изолированы, однако, из-за отсутствия опыта борьбы с Некроморфами, мутанты быстро распространились по колонии. Оставшиеся в живых в спешке разработали устройство, способное усиливать излучения Метки, после чего ученые и весь персонал комплекса запечатали Маркером Разум Роя на планете, покинули исследовательские центры, уничтожив все улики и объявили систему Эгиды запретной зоной.
Через двести лет, корпорация CEC обнаружила на планете в системе Эгиды просто огромные запасы полезных ресурсов и, в погоне за прибылью, начала нелегальную разработку планеты. Вскоре, колонисты обнаружили Красную Метку и посчитали его появление знамением божьим, после чего к планете был выслан корабль USG Ishimura, на котором большая часть экипажа (После вмешательства церкви) была заменена приверженцами церкви Унитологии.

И так, это была предыстория... Кратко но для того что бы понять общий смысл думаю достаточно. И так действия протекают параллельно компьютерной игре, не затрагивая ее как таковую. После того как с Ишимуры прекратил поступать радио сигнал особого значения этому никто не предал. Ибо на таком гиганте как Ишимура десятки техников которые способны справиться с такой маленькой неполадкой. Пустяк так сказать... Но сигнал отсутствовал довольно верхушки заволновались. После не очень долгого и в принципе не обязательного совещания было решено отправить развед группу состоящую из инженеров на Ишимуру для выяснения и устранения неполадок. Не долгие сборы и экипаж был готов к отправлению. На небольшом челноке развед-ремонтная группа прибыла в систему Эгида, к злочастной планете на орбите которой висела Ишимура, громадная станция по добыче ресурсов. Странно но никаких признаков жизни станция не подавала. Не горели даже габаритные огни. Радио тоже по прежнему молчало... Только обрывки каких то фраз, которые невозможно было разобрать из за сломанного дешифратора. Решением капитана было посадить челнок в доках Ишимуры и приступить к исследованию и устранению неполадок, а так же выяснению что же тут все таки произошло. Но гладкой посадке не суждено было быть. Авто-посадка по идее должна была пройти гладко но в двигатель челнока врезался астероид, так как системы защиты Ишимуры от них не работали. Ну и кораблик вместе со всем экипажем дружно ушел в пике, и если бы не пилот который вовремя переключился на ручное управление... Вообщем с горем пополам челнок был посажен и команда выгрузилась на борт станции. И каково же их удивление было когда они там никого не обнаружили. Пустые доки... Пустые залы ожидания. Пустые коридоры и лиш по всюду пятна крови... Да еще и странные звуки которые разносятся по всему кораблю, скрежет, стоны, крики... И как всегда в лучших традициях вместо того что бы бежать с этой проклятой станции команда решила разобраться в происходящем...